|
شناسایی آنالوگ‌های ژن‌های مقاومت به بیماری (RGAs) در جمعیت F1 درحال تفرق سیب‌زمینی با استفاده از تکنیک NBS profiling
|
| سارا دژستان، محمد مقدم، سید ابوالقاسم محمدی، سعید اهری راد، ژاک وسن |
| دانشکده کشاورزی دانشگاه تبریز |
|
|
چکیده: (3963 مشاهده) |
| به‌منظور شناسایی و جداسازی آنالوگ‌های ژن‌های مقاومت (RGAs) در سیب‌زمینی، 46 ژنوتیپ از جمعیت F1 درحال تفرق دیپلوئید RH×SH با حداکثر نوترکیبی با استفاده از تکنیک NBS Profiling در آزمایشگاه ژنومیکس دانشگاه واگنینگن هلند مورد ارزیابی قرار گرفتند. با استفاده از پنج آغازگر دژنره طراحی‌شده براساس موتیف‌های حفاظت‌شده دامنه NBS، در مجموع 187 نشانگر چندشکل تولید شد که در ارتباط با نقشه AFLP جمعیت متشکل از 10000 نشانگر مکان‌یابی شدند. پس از توالی‌یابی تعدادی از نشانگرها و همردیف کردن آنها، 68 نشانگر با ژن‌های مقاومت شناخته‌شده یا پروتئین‌های مقاومت به بیماری گروه TIR-NBS-LRR همولوژی نشان دادند. هفت تا از این RGAها جایگاه ژنی و توالی مشابه با ژن‌های مقاومت شناسایی‌شده در سیب‌زمینی یا گوجه-فرنگی داشتند. سی‌و‌هفت RGA توالی‌یابی‌شده در نواحی کروموزومی مشابه با ژن‌های مقاومت شناسایی‌شده یا RGAها در گوجه-فرنگی یا سیب‌زمینی مکان‌یابی شدند بدون اینکه با این ژن‌های مقاومت یا RGAها از نظر توالی دارای همولوژی باشند و بقیه RGAها نیز در جایگاه‌هایی مکان‌یابی شدند که تاکنون در آنها RGA گزارش نشده است. اکثر این RGA ها در خوشه‌ها یا زیرخوشه-های جدید یا موجود در نقشه قرار گرفتند. در بررسی رابطه فیلوژنی، توالی‌های RGA براساس آغازگر دژنره مورداستفاده برای تکثیر تفکیک شدند. نتایج حاصل از این پژوهش می‌تواند در مکان‌یابی ژن‌های مقاومت منفرد و مکان‌های کمی مقاومت به بیماری‌ها مورداستفاده قرار گیرد. |
|
| واژه‌های کلیدی: آنالوگ‌های جمعیت نقشه‌یابی، ژن‌های مقاومت به بیماری (RGAs)، سیب‌زمینی و .NBS Profiling |
|
|
متن کامل [PDF 903 kb]
(1502 دریافت)
|
نوع مطالعه: پژوهشي |
موضوع مقاله:
تخصصي
دریافت: 1393/12/3 | پذیرش: 1393/12/3 | انتشار: 1393/12/3
|
|
|
|
|
|
|
| ارسال پیام به نویسنده مسئول |
|
|
|
| ارسال نظر درباره این مقاله |
|
|
|
