[صفحه اصلی ]   [Archive] [ English ]  
:: صفحه اصلي :: درباره نشريه :: آخرين شماره :: تمام شماره‌ها :: جستجو :: ثبت نام :: ارسال مقاله :: تماس با ما ::
:: دوره 22، شماره 2 - ( تابستان 1399 ) ::
جلد 22 شماره 2 صفحات 152-167 برگشت به فهرست نسخه ها
انتقال پذیری نشانگرهای ریزماهواره جو برای ارزیابی روابط ژنتیکی در خویشاوندان وحشی گندم جنس‌های Triticum و Aegilops
احمد احمدی لکی، سید ابوالقاسم محمدی، محمد مقدم، مصطفی ولیزاده
دانشکده کشاورزی دانشگاه تبریز و عضو قطب علمی اصلاح مولکولی غلات
چکیده:   (192 مشاهده)
ژنومیک مقایسه­ای هم‌خطی بین ژنوم گونه­های خویشاوند نزدیک گیاهی را با دقت بالایی نشان داده و امکان تبادل نشانگرها بین آن­ها را فراهم می‌سازد. هدف این تحقیق ارزیابی انتقال­پذیری نشانگرهای ریزماهواره جو بین گونه­های جنس­های Triticum و Aegilops برای تعیین روابط ژنتیکی آن­ها بود. آزمایش در سال 1395در دانشکده کشاورزی دانشگاه تبریز انجام شد.  از 165 جفت آغازگر ریزماهواره جو مورد بررسی در 40 ژنوتیپ از نه گونه از جنس‌­های Triticum و Aegilops، 62 جفت آغازگر
 (5/37 درصد) در ژنوم یکی از گونه­های مورد مطالعه تکثیر موفق داشت و 50 جفت آغازگر (3/30 درصد) الگوی نواری چند شکل ایجاد کردند. با استفاده از 50 جفت آغازگر چند شکل، 223 آلل با دامنه 2 تا 14 و میانگین 46/4 الل به ازای هر جایگاه تکثیر شد. میانگین اطلاعات چند شکلی و تنوع ژنی به ترتیب 55/0 و 60/0 برآورد شد. ژنوتیپ­های مورد مطالعه با استفاده الگوریتم تجزیه خوشه­ای و ضریب فاصله تکاملی به چهار گروه تفکیک شدند. گونه­های جنس­های Triticum و Aegilops در دو گروه جداگانه قرار گرفته و در داخل هر جنس نیز گروه­بندی با ساختار ژنوم آن­ها تطابق داشت. در تجزیه به بردارهای اصلی، دو بردار اصلی اول به ترتیب 6/24 و 8/21 درصد از تنوع مولکولی را توجیه کردند و توزیع ژنوتیپ­ها براساس این دو بردار با گروه­بندی تجزیه خوشه­ای مطابقت داشت. نتایج این آزمایش نشان داد که از نشانگرهای انتقال­پذیر جو می­توان با موفقیت در مطالعات ژنتیکی
و به­نژادی در گندم و خویشاوندان آن استفاده کرد.
واژه‌های کلیدی: انتقال‌پذیری، تنوع ژنتیکی، جو، خویشاوندان وحشی گندم و نشانگرهای ریزماهواره.
متن کامل [PDF 797 kb]   (61 دریافت)    
نوع مطالعه: پژوهشي | موضوع مقاله: تخصصي
دریافت: 1399/6/19 | پذیرش: 1399/6/10 | انتشار: 1399/6/10
فهرست منابع
1. رفرنس های متنی مثل خروجی کراس رف را در اینجا وارد کرده و تایید کنید Adonina, I.G., E.A. Salina, E.G. Pestsova and M.S. Röder. 2005. Transferability of wheat microsatellites to diploid Aegilops species and determination of chromosomal localizations of microsatellites in the S genome. Genome 48: 959-970.##Ahn, S., J.A. Anderson, M.E. Sorrells and S.D. Tanksley. 1993. Homoeologous relationships of rice, wheat and maize chromosomes. Mol. Genet. Genomics 241: 483-490.##Andrew, H., J.E. Paterson, M.D. Bawers, X.D. Buraw, G.E. Christin and J.W. Robert. 2000. Comparative genomics of plant chromosomes. Plant Cell Rep. 12: 1523-1539.##Beales, J., A. Turner, S. Griffiths, J.W. Snape and D.A. Laurie. 2007. A pseudo-response regulator is misexpressed in the photoperiod insensitive Ppd-D1a mutant of wheat (Triticum aestivum L.). Theor. Appl. Genet. 115: 721-733.##Bennetzen, J.L. and M. Freeling. 1997. The unified grass genome: synergy in synteny. Genome. Res. 7: 301-306.##Botstein, D., R.L. White, M. Skolnick and R.W. Davis. 1980. Construction of a genetic linkage map in man using restriction fragment length polymorphisms. Am. J. Hum. Genet. 32: 314-331. ##Castillo, A., G. Dorado, C. Feuillet, P. Sourdille and P. Hernandez. 2010. Genetic structure and ecogeographical adaptation in wild barley as revealed by microsatellite markers. BMC Plant Biol. 10: 266-279.##Castillo, A., H. Budak, A. C. Martin, G. Dorado, A. Borner, M. Roder and P. Hernandez. 2009. Interspecies and intergenus transferability of barley and wheat D-genome microsatellite markers. Ann. Appl. Biol. 156: 347-356.##Castillo, A., H. Budak, R.K. Varshney, G. Dorado, A. Graner and P. Hernandez. 2008. Transferability and polymorphism of barley EST-SSR markers used for phylogenetic analysis in Hordeum chilense. BMC Plant Biol. 8: 97-100.##Colmer, T. D., T. J. Flowers and R. Munns. 2006. Use of wild relatives to improve salt tolerance in wheat. J. Exp. Bot. 57: 1059-1078.##Fahima, T., M.S. Roder, A. Grama and E. Nevo. 1998. Microsatellite DNA polymorphism divergence in Triticum dicoccoides accessions highly resistant to yellow rust. Theor. Appl. Genet. 96: 187-195.##Feldman, M. and A.A. Levy. 2005. Allopolyploidy- a shaping force in the evolution of wheat genomes. Cytogenet. Genome Res. 109: 250-258.##Feuillet, C. and G.J. Muehlbauer. 2009. Genetics and Genomics of the Triticeae. Plant Genetics and Genomics. Springer.##Gororo, N.N., H.A. Hagles, R.F. Eastwood, M.E. Nicolas and R.G. Flood. 2002. Use of Triticum tauschii to improve yield of wheat in low-yielding environments. Euphytica 123: 241-254.##Holton, T.A., J.T. Christopher, L. McClure, N. Harker and R.J. Henry. 2002. Identification and mapping of polymorphic SSR markers from expressed gene sequences of barley and wheat. Mol. Breed. 9: 63-71.##Hovhannisyan, N.A., M.E. Dulloo, A.H. Yesayan, H. Knupffer and A. Amri. 2011. Tracking of powdery mildew and leaf rust resistance genes in Triticum boeoticum and T. urartu, wild relatives of common wheat. Czech J. Genet. Plant Breed. 47: 45-57.##Huang, S.X., A. Sirikhachornkit, X.J. Su, J. Faris, B. Gill, R. Haselkorn and P. Gornicki. 2002. Genes encoding plastid acetyl-CoA carboxylase and 3-phosphoglycerate kinase of the Triticum/Aegilops complex and evolutionary history of polyploid wheat. Proc. Nat. Acad. Sci. USA 99: 8133-8138.##Hulbert, S.H., T.E. Richter, J.D. Axtell and J.L. Bennetzen. 1990. Genetic mapping and characterization of sorghum and related crops by means of maize DNA probes. Proc. Nat. Acad. Sci. USA 87: 4251-4255.##Korzun, V., M.S. Roder, K. Wedehake, A. Pasqualone, C. Lotti, M.W. Ganal and A. Blanco. 1999. Integration of dinucleotide microsatellites from hexaploid bread wheat into a genetic linkage map of durum wheat. Theor. Appl. Genet. 98: 1202-1207.##Kuleung, C., P.S. Baenziger and I. Dweikat. 2004. Transferability of SSR markers among wheat, rye, and triticale. Theor. Appl. Genet. 108: 1147-1150.##Kurata, N., G. Moore, Y. Nagamura, T. Foote, M. Yano, Y. Minobe and M.D. Gale. 1994. Conservation of genome structure between rice and wheat. BioTechnol. 12: 276-278.##Li, J.Z., T.G. Sjakste, M.S. Roder and M.W. Ganal. 2003. Development and genetic mapping of 127 new microsatellite markers in barley. Theor. Appl. Genet. 107: 1021-1027.##Lina, M.A., Y.M. Mohammad and H. Nadia. 2012. The genetic relationships among Aegilops L. and Triticum L. species. Asian J. Agric. Sci. 4: 352-367.##Liu. K. and S.V. Muse. 2005. Power Marker: Integrated analysis environment for genetic marker data. Bioinformatics 2: 2128-2129. ##Maestra, B. and T. Naranjo. 2000. Genome evolution in Triticeae. In: Olmo E., Redi C.A. (Eds.) Chromosomes Today. Birkhäuser, Basel, pp. 155-167.##Magurran, A.E. 2004. Measuring Biological Diversity. Blackwell.##Mason-Gamer, R.J. 2005. The ß-amylase genes of grasses and a phylogenetic analysis of the Triticeae (Poaceae). Am. J. Bot. 92: 1045-1058.##Miki, Y., K. Yoshida, N. Mizuno, S. Nasuda, K. Sato and S. Takumi. 2019. Origin of wheat B-genome chromosomes inferred from RNA sequencing analysis of leaf transcripts from section Sitopsis species of Aegilops. DNA Res. 26(2): 171-182.##Nei, M. 1973. Analysis of gene diversity in subdivided populations. Proc. Nat. Acad. Sci. USA. 70: 3321-3323.##Nei, M. 1978. Estimation of average heterozygosity and genetic distance from a small number of individuals. Genetics 89: 583-590.##Oliveira, E.J., J.G. Paìdua, M.I. Zucch, R. Vencovsky and M.L.C. Vieira. 2006. Origin, evolution and genome distribution of microsatellites. Genet. Mol. Res. 29: 294-307.##Peakall, R. and P. Smouse. 2012. GenAlEx 6.5: Genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching and research, an update. Bioinformatics 28: 2537-2539.##Pestsova, E., V. Korzun, N.P. Goncharov, K. Hammer, M.W. Ganal and M.S. Röder. 2000. Microsatellite analysis of Aegilops tauschii germplasm. Theor. Appl. Genet. 101: 100-106.##Petersen, G. and O. Seberg. 2005. Phylogenetic analysis of allopolyploid species. Czech J. Genet. Plant Breed. 41: 28-37.##Ramsay, L., M. Macaulay, D. S. Ivanissevich, K. MacLean, L. Cardle, J. Fuller, K. J. Edwards, S. Tuvesson, M. Morgante, A. Massari, E. Maestri, N. Marmiroli, T. Sjakste, M. Ganal, W. Powell and R. A. Waugh. 2000. Simple sequence repeat-based linkage map of barley. Genetics, 156: 1997-2005.##Röder, M.S., J. Plaschke, S.U. Konig, A. Borner, M.E. Sorrells, S.D. Tanksley and M.W. Ganal. 1995. Abundance, variability and chromosomal location of microsatellites in wheat. Mol. Gen. Genet. 246: 327-333.##Rodriguez-Suarez, C., M.C. Ramirez, A. Martin and S.G. Atienza. 2011. Applicability of chromosome-specific SSR wheat markers for the introgression of Triticum urartu in durum wheat breeding programmes. Plant Genet. Resour. 9: 439-444.##Safari, Z. and A.A. Mehrabi. 2019. Molecular phylogeny of Aegilops L. and Triticum L. species revealed by internal transcribed spacers of ribosomal genes. J. Agric. Sci. Technol. 21(3): 699-714.##Saghai Maroof, M.A., R.M. Biyashev, G.P. Yang, Q. Zhangf and R.W. Allard. 1994. Extraordinarily polymorphic microsatellite DNA in barley: Species diversity, chromosomal locations and population dynamics. Proc. Nat. Acad. Sci. USA 91: 5466-5470.##Schneider, A., I. Molnár and M. Molnár-Láng. 2008. Utilisation of Aegilops (goatgrass) species to widen the genetic diversity of cultivated wheat. Euphytica, 163(1): 1-19.##Sharma, S., H.S. Balyan, P.L. Kulwal, N. Kumar, R.K. Varshney, M. Prasad and P.K. Gupta. 2002. Study of interspecific SSR polymorphism among 14 species from Triticum-Aegilops group. Wheat Info. Serv. 95: 23-28.##Sourdille, P., M. Tavaud, G. Charmet and M. Bernard. 2001. Transferability of wheat microsatellites to diploid Triticeae species carrying the A, B and D genomes. Theor. Appl. Genet. 103: 346-352.##Tamura, K., D. Peterson, N. Peterson, G. Stecher, M. Nei and S. Kumar. 2011. MEGA5: Molecular evolutionary genetics analysis using maximum likelihood, evolutionary distance, and maximum parsimony methods. Mol. Biol. Evol. 28(10): 2731-2739.##Tilman, D., C. Balzer, J. Hill and B. L. Belfort. 2011. Global food demand and the sustainable intensification of agriculture. Proc. Nat. Acad. Sci. USA 108: 20260-20264.##Varshney, R.K., R. Sigmund, A. Börner, V. Korzun, N. Stein, M.E. Sorrells, P. Langridge and A. Graner. 2005. Interspecific transferability and comparative mapping of barley EST-SSR markers in wheat, rye and rice. Plant Sci. 168: 195-202.##Yildirim, A., N. Kandemir, O. Ates Sonmezoglu and T. Eserkaya Gulec. 2009. Transferability of microsatellite markers among cool season cereals. Biotechnol. Biotechnol. Equip. 23: 1299-1302. ##Zhang, L. 2006. Study of the transferability of microsatellite markers derived from bread wheat (T. aestivum) or rice (O. sativa) ESTs (EST-SSRs) to their close and wild relative and evaluation of their potential for the organization of genetic resources in the grass family. Vegetal Biology, Universite Blaise Pascal.##
ارسال نظر درباره این مقاله
نام کاربری یا پست الکترونیک شما:

CAPTCHA



XML   English Abstract   Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Ahmadi Laki A, Mohammadi, Moghaddam M, Valizadeh M. Transferability of barley microsatellite markers for assessing genetic relationships of wheat wild relatives of Triticum and Aegilops genera. علوم زراعی. 2020; 22 (2) :152-167
URL: http://agrobreedjournal.ir/article-1-1140-fa.html

احمدی لکی احمد، محمدی سید ابوالقاسم، مقدم محمد، ولیزاده مصطفی. انتقال پذیری نشانگرهای ریزماهواره جو برای ارزیابی روابط ژنتیکی در خویشاوندان وحشی گندم جنس‌های Triticum و Aegilops. نشریه علوم زراعی ایران. 1399; 22 (2) :152-167

URL: http://agrobreedjournal.ir/article-1-1140-fa.html



دوره 22، شماره 2 - ( تابستان 1399 ) برگشت به فهرست نسخه ها
نشریه علوم زراعی ایران Iranian Journal of Crop Sciences
Persian site map - English site map - Created in 0.05 seconds with 30 queries by YEKTAWEB 4237