<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>Iranian Society of Crops and Plant Breeding Sciences</title>
<title_fa>نشریه علوم زراعی ایران</title_fa>
<short_title>Iranian Journal of Crop Sciences.</short_title>
<subject>Agriculture</subject>
<web_url>http://agrobreedjournal.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>1</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>admin</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>1562-5540</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>2717-0527</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii>8</journal_id_pii>
<journal_id_doi>10.52547/abj</journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid>14</journal_id_sid>
<journal_id_nlai>8888</journal_id_nlai>
<journal_id_science>13</journal_id_science>
<language>fa</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1397</year>
	<month>12</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2019</year>
	<month>3</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>20</volume>
<number>4</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>fa</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>ارزیابی تنوع و اعتبار سنجی نشانگرهای ریزماهواره پیوسته با تحمل تنش شوری در ژنوتیپ‌های برنج (Oryza sativa L.)</title_fa>
	<title> 
Assessment of diversity and validation of microsatellite markesr associated with salinity tolerance in rice (Oryza sativa L.) genotypes
</title>
	<subject_fa>تخصصي</subject_fa>
	<subject>Special</subject>
	<content_type_fa>پژوهشي</content_type_fa>
	<content_type>Scientific &amp; Research</content_type>
	<abstract_fa>&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;این تحقیق به منظور اعتبارسنجی تعداد 10 نشانگر ریزماهواره پیوسته با ژن&#8204;ها و جایگاه&#8204;های مختلف تحمل شوری از جمله ژن &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman bold,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;Saltol&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt; که به فاصله صفر تا هشت سانتی&#8204;مورگان از جایگاه&#8204;های ژنی قرار داشته و ارزیابی تنوع آللی این ژن&#8204;ها در 59 ژنوتیپ &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;برنج طی سال&#8204;های90-1388 در موسسه تحقیقات برنج کشور انجام شد. در این آزمایش ارزیابی برای تعدادی از صفات مورفولوژیک مهم مرتبط با تحمل تنش شوری شامل نمره تحمل شوری، ارتفاع گیاهچه، وزن خشک ریشه، وزن خشک اندام هوایی و محتوای آب نسبی برگ انجام شد. ژنوتیپ&#8204;های برنج در مرحله گیاهچه&#8204;ای در دو تیمار 9/0 دسی&#8204;زیمنس بر متر (بدون تنش) &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;و 12 دسی&#8204;زیمنس بر متر (تنش شوری) مورد ارزیابی قرار گرفتند. غربال مولکولی با استفاده از 10 نشانگر مورد استفاده در ژنوتیپ&#8204;های برنج مورد مطالعه، 60 آلل را در ژنوتیپ&#8204;های برنج ایجاد نمود. نتایج حاصل از تجزیه رگرسیون لجستیک نشان داد که از 10 جایگاه ریزماهواره پیوسته، چهار نشانگر توجیه&#8204;کننده تغییرات در واکنش به شوری به&#8204;ترتیب &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman bold,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;RM315&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt; برای ارتفاع گیاهچه، &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman bold,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;RM223&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt; برای وزن خشک ریشه و ارتفاع گیاهچه، &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman bold,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;RM3627&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt; برای وزن خشک ریشه، ارتفاع گیاهچه و محتوای آب نسبی برگ و &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman bold,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;RM8094&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt; برای برای وزن خشک ریشه و محتوای آب نسبی برگ بودند. بر اساس تجزیه خوشه&#8204;ای براساس داده&#8204;های مولکولی با استفاده از ضریب &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman bold,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;Yule&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt; و روش &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman bold,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;UPGMA&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;، ژنوتیپ&#8204;های برنج به پنج گروه تقسیم شدند. با توجه به اینکه سه نشانگر پیوسته شناسایی شده (&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman bold,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;RM8094&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt; ، &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman bold,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;RM3627&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt; و &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman bold,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;RM315&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;) روی کروموزوم یک واقع شده و با ژن &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman bold,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;Saltol&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt; نیز پیوسته هستند، می&#8204;توان از آنها در شناسایی ژنوتیپ&#8204;های متحمل و حساس برنج استفاده کرده و ژنوتیپ&#8204;های واجد این جایگاه&#8204;ها را در برنامه&#8204;های اصلاح برای تحمل به شوری مورد استفاده قرار داد.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;br&gt;
&amp;nbsp;</abstract_fa>
	<abstract>Ten SSR morkers linked to different genes and QTLs responsible for the salinity tolerance in rice, including &lt;em&gt;Saltol&lt;/em&gt; QTL which located between zero to 8 CM of the genes, were used to validate their co-segregation with salinity tolerance. Fifty nine diverse rice genotypes including local and improved cultivars mostly from Iran and few exotic rice genotypes were tested during 2009-2011 at Rice Research Institute of Iran, and data were collected on several important traits such as salinity tolerance, seedling height, root dry matter, shoot dry matter and leaf relative water content (RWC). The treatments were: a. control with an electrical conductivity of 0.9 dS.m&lt;sup&gt;-1&lt;/sup&gt; and b. salinity stress with EC = 12 dS.m&lt;sup&gt;-1&lt;/sup&gt; for all rice genotypes at seedling stage. Molecular screening for 10 SSR linked marker showed that they amplified 60 alleles among rice genotypes. We identified four SSR markers which significantly co-segregated with at least one trait that was involved in salinity tolerance including; RM315 with seedling height, RM223 with root dry weight and seedling height, RM3627 with root dry weight, seedling height and RWC; and RM8094 with root dry weight and RWC. Molecular data clustering through UPGMA method and Yule coefficient also classified rice genotypes into five major clusters with tolerance to susceptible reactions. As three aforementioned SSR markers; RM315, RM3627 and RM8094 are located on chromosome 1, closely linked to &lt;em&gt;Saltol&lt;/em&gt; QTL, and co-segreated with different traits in this experiment, they could be employed to differentiate salinity tolerant rice genotypes in rice breeding programs in Iran.&amp;nbsp;&amp;nbsp;&lt;br&gt;
&amp;nbsp;</abstract>
	<keyword_fa>برنج, تنش شوری, تنوع ژنتیکی, ریزماهواره و نشانگرهای پیوسته. </keyword_fa>
	<keyword>Genetic diversity, Linked markers, Salinity stress, Microsatellite and Rice. 

</keyword>
	<start_page>345</start_page>
	<end_page>361</end_page>
	<web_url>http://agrobreedjournal.ir/browse.php?a_code=A-10-1-580&amp;slc_lang=fa&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>Seyedeh Amene</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Rouhani</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>سیده آمنه</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>روحانی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>10031947532846005259</code>
	<orcid>10031947532846005259</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Graduated MSc. Student, Zanjan University, Zanja, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>دانش‌آموخته کارشناسی ارشد بیوتکنولوژی کشاورزی دانشگاه زنجان</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Ali</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Moumeni</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>علی</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>مومنی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>amoumeni@areeo.ac.ir</email>
	<code>10031947532846005260</code>
	<orcid>10031947532846005260</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation>Associate Prof., Rice Research Institute of Iran, Mazandaran Branch, Amol. Agricutural Research, Education and Extension (AREEO), Iran </affiliation>
	<affiliation_fa>دانشیار موسسه تحقیقات برنج کشور- معاونت مازندران، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Ali Akbar</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Ebadi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>علی اکبر</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>عبادی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>10031947532846005261</code>
	<orcid>10031947532846005261</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Assistant Prof., Rice Research Institute of Iran, Rasht. Agricutural Research, Education and Extension (AREEO), Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>استادیار موسسه تحقیقات برنج کشور- رشت، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Behzad</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Ghareyazie</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>بهزاد</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>قره یاضی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>10031947532846005262</code>
	<orcid>10031947532846005262</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Professor, Agricultural Biotechnology Research Institute of Iran, Karaj, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>استاد پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی ایران، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی.</affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
