|
ارزیابی تنوع ژنتیکی در نمونه‌های دو گونه جو (L. H. vulgare و.H. spontaneum L. ) با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره
|
| امین ابراهیمی، محمدرضا نقوی، منی‍ژه سبکدست، محسن مردی |
| پردیس کشاورزی و منابع طبیعی د انشگاه تهران |
|
|
چکیده: (3545 مشاهده) |
| در این آزمایش تنوع ژنتیکی 73 نمونه جو ایران از دو گونه H. vulgare و H. spontaneum با استفاده از 15 جفت نشانگر ریزماهواره مورد ارزیابی قرار گرفت. الگو های نواری بصورت صفر (عدم وجود باند) و یک (وجود باند) امتیاز دهی شدند. برای رسم دندروگرام ابتدا ماتریس تشابه با روش دایس تشکیل و سپس دندروگرام با استفاده از الگوریتم UPGMA با نرم افزار NTSYSpc 2.0 رسم شد. همچنین از این نرم افزار برای رسم پراکنش نمونه‌ها در دو بعد اول تجزیه به مختصات اصلی (PCoA) نیز استفاده شد. بیشترین تعداد آلل در گونه H. vulgare مربوط به جایگاه‌های Bmac0316 و Hvm40 با 8 آلل و کمترین آن مربوط به جایگاه Hvm70 با دو شکل بود. بیشترین تعداد آلل در گونهH. spontaneum مربوط به جایگاه Hvm40 (با 9 آلل) و کمترین آن مربوط به جایگاه‌های Hvm70 و HvmLoH1A (با 2 آلل) بود. میزان PIC درگونه H. vulgare
از80/0 (جایگاه Bmac0040) تا 19/0 (جایگاه Bmag0603) و در گونه H. spontaneum از 91/0 (جایگاه Bmac0415) تا 043/0 (جایگاه Hvm70) متغیر بود. تجزیه خوشه‌ای با استفاده از ضریب دایس و الگوریتم UPGMA نمونه‌ها را به سه گروه تقسیم کرد. گروه اول شامل نمونه‌هایی از هر دو گونه H. spontaneum و H. vulgare که از ایران جمع آوری شده‌اند و گروه‌های دوم و سوم نیز به ترتیب شامل نمونه‌هایی از گونه‌های H. spontaneum و H. vulgare بود. نتایج حاصل از تجزیه به مختصات اصلی با نتایج حاصل از تجزیه خوشه‌ای همخوانی داشت. نتایج این تحقیق نشان داد که نشانگرهای ریزماهواره برای بررسی تنوع در هر
دو گونهH. spontaneum و H. vulgare مفید می‌باشند. جایگاه‌های HvmLoH1A و Ebmac0415 در
گونه H. spontaneum و جایگاه‌های Bmac0306 و Bamc0040 در گونه H. vulgare برای بررسی تنوع در این گونه‌ها مناسب تشخیص داده شدند. |
|
| واژه‌های کلیدی: تنوع ژنتیکی، جو، نشانگرهای ریز ماهواره، H. spontaneumو H. vulgare. |
|
|
متن کامل [PDF 360 kb]
(2499 دریافت)
|
نوع مطالعه: پژوهشي |
موضوع مقاله:
تخصصي
دریافت: 1393/12/3 | پذیرش: 1393/12/3 | انتشار: 1393/12/3
|
|
|
|
|
|
