fa ارزیابی فراوانی آللی و تجزیه ارتباطی نشانگرهای ریزماهواره با برخی صفات مرتبط با جوانه‌زنی پیش از برداشت در ارقام برنج (Oryza sativa L.) تخصصي Special پژوهشي Scientific & Research <p dir="RTL"><a name="OLE_LINK332"></a><a name="OLE_LINK331"><strong>به منظور ارزیابی فراوانی آللی و تجزیه ارتباطی نشانگرهای ریز ماهواره با برخی از صفات مرتبط با جوانه‌زنی پیش از برداشت، تعداد 34 رقم برنج بومی و اصلاح شده </strong></a><a name="OLE_LINK74"></a><a name="OLE_LINK75"><strong>در قالب طرح بلوک‌های کامل تصادفی با دو تکرار در بهار سال 1392 در مزرعه تحقیقاتی دانشکده کشاورزی دانشگاه گیلان</strong></a><strong> کشت و صفات مرتبط با جوانه‌زنی پیش از برداشت در آنها اندازه‌گیری شد. همچنین الگوی نوار‌های 20 نشانگر ریزماهواره <a name="OLE_LINK45"></a><a name="OLE_LINK73">تعیین و ارتباط آنها با صفات اندازه‌گیری شده </a>مورد بررسی قرار گرفت. نتایج تجزیه واریانس نشان داد که ژنوتیپ‌های برنج مورد بررسی برای کلیه صفات دارای اختلاف</strong> <strong>معنی‌داری بودند که حاکی از وجود تنوع ژنتیکی برای صفات مرتبط با جوانه‌زنی پیش از برداشت در این ارقام می‌باشد. در این آزمایش، میانگین تعداد آلل موثر، شاخص شانون و میزان اطلاعات چند شکل برای نشانگر‌های مورد بررسی به ترتیب 95/2، 14/1 و 59/0 بدست آمد. در تجزیه ارتباط بین نشانگرها و صفات، بالاترین ضریب تبیین با مقدار 47 درصد متعلق به چهار نشانگر </strong><strong><span dir="LTR">RM282</span></strong><strong>، </strong><strong><span dir="LTR">RM220</span></strong><strong>، </strong><strong><span dir="LTR">RM447</span></strong><strong> و </strong><strong><span dir="LTR">RM320</span></strong><strong> برای صفت شکل دانه بود. برای صفات درصد جوانه‌زنی پیش از برداشت و درصد جوانه‌زنی پیش از برداشت بر حسب تعداد دانه پر نیز یک نشانگر مشترک </strong><strong><span dir="LTR">RM525</span></strong><strong> به ترتیب 9 و 14 درصد از تغییرات این دو صفت را توجیه کرد. برای صفات فراوانی دانه جوانه‌زده در طول خوشه و میزان فعالیت آنزیم آلفا آمیلاز نیز به طور مشترک نشانگرهای </strong><strong><span dir="LTR">RM525</span></strong><strong>، </strong><strong><span dir="LTR">RM447</span></strong><strong> و </strong><strong><span dir="LTR">RM124</span></strong><strong> به ترتیب 31 و 28 درصد ارتباط را به خود اختصاص دادند.<a name="OLE_LINK119"> با توجه به ارتباط بالا‌ی این نشانگر‌ها، پویش در نواحی کروموزومی مجاور آنها می‌تواند در شناسایی ژن‌های کنترل کننده صفت جوانه‌زنی پیش از برداشت در ژنوتیپ‌های برنج مؤثر باشد</a>. </strong></p> <p>To study allelic frequency and association analysis of microsatellite markers with some traits related to pre-harvest sprouting in rice, 34 local varieties/ improved rice cultivars were planted in research field of Faculty of Agricultural Sciences, University of Guilan, Rasht, Iran, in 2013 cropping season. Traits related to pre-harvest sprouting were measured in the field and recorded. Also the banding pattern of 20 microsatellite markers was determined and their association was evaluated with these traits. Results analysis of variance showed that had significant differences for all traits at 1% of probability level that implies high genetic variation for traits related to pre-harvest sprouting. Results of allelic diversity revealed average number of effective alleles, Shannon&rsquo;s index and polymorphic information content equal to 2.95, 1.14 and 0.59, respectively. Association analysis between microsatellite markers and traits showed the highest coefficient of determination with 47% explained by four markers RM282, RM220, RM447 and RM320 for grain shape. For pre-harvest sprouting (%) and pre-harvest sprouting (%) based on the number of filled grain, a common marker, RM525, explained 9% and 14%&nbsp; of the variation observed for these two characteristics, respectively. Markers RM525, RM447 and RM124 commonly showed 31% and 28% association with two traits, frequency of sprouted seeds in the panicle and Alpha-amylase enzyme activity, respectively. Therefore, due to significant association of these markers, scanning of adjacent chromosomal regions can be useful for identifying allels controlling traits related to pre-harvest sprouting in rice.&nbsp;</p> برنج, آنزیم آلفا آمیلاز, جوانه‌زنی پیش از برداشت و نشانگرهای مولکولی. Alpha amylase enzyme, Molecular markers, Pre-harvest sprouting and Rice 49 62 http://agrobreedjournal.ir/browse.php?a_code=A-10-1-505&slc_lang=fa&sid=1 Soheila Nikzade Talebi سهیلا نیک زاده طالبی ali_aalami@guilan.ac.ir 100319475328460010843 100319475328460010843 No دانشکده علوم کشاورزی دانشگاه کیلان Ali Aalami علی اعلمی ali_aalami@guilan.ac.ir 100319475328460010844 100319475328460010844 Yes دانشکده علوم کشاورزی دانشگاه کیلان Masoud Esfahani مسعود اصفهانی ali_aalami@guilan.ac.ir 100319475328460010845 100319475328460010845 No دانشکده علوم کشاورزی دانشگاه کیلان Aliakbar Ebadi علی اکبر عبادی ali_aalami@guilan.ac.ir 100319475328460010846 100319475328460010846 No مؤسسه تحقیقات برنج کشور، رشت