<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>Iranian Society of Crops and Plant Breeding Sciences</title>
<title_fa>نشریه علوم زراعی ایران</title_fa>
<short_title>Iranian Journal of Crop Sciences.</short_title>
<subject>Agriculture</subject>
<web_url>http://agrobreedjournal.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>1</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>admin</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>1562-5540</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>2717-0527</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii>8</journal_id_pii>
<journal_id_doi>10.52547/abj</journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid>14</journal_id_sid>
<journal_id_nlai>8888</journal_id_nlai>
<journal_id_science>13</journal_id_science>
<language>fa</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1389</year>
	<month>4</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2010</year>
	<month>7</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>12</volume>
<number>2</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>fa</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>شناسایی آنالوگ‌های ژن‌های مقاومت به بیماری (RGAs) در جمعیت F1 درحال تفرق سیب‌زمینی با استفاده از تکنیک NBS profiling</title_fa>
	<title>Identification of resistance gene analogues (RGAs) in F1 mapping population of potato using NBS profiling technique</title>
	<subject_fa>تخصصي</subject_fa>
	<subject>Special</subject>
	<content_type_fa>پژوهشي</content_type_fa>
	<content_type>Scientific &amp; Research</content_type>
	<abstract_fa>به&#8204;منظور شناسایی و جداسازی آنالوگ&#8204;های ژن&#8204;های مقاومت (RGAs) در سیب&#8204;زمینی، 46 ژنوتیپ&#8204; از جمعیت F1 درحال تفرق دیپلوئید RH&amp;times;SH با حداکثر نوترکیبی با استفاده از تکنیک NBS Profiling در آزمایشگاه ژنومیکس دانشگاه واگنینگن هلند مورد ارزیابی قرار گرفتند. با استفاده از پنج آغازگر دژنره طراحی&#8204;شده براساس موتیف&#8204;های حفاظت&#8204;شده دامنه NBS، در مجموع 187 نشانگر چندشکل تولید شد که در ارتباط با نقشه AFLP جمعیت متشکل از 10000 نشانگر مکان&#8204;یابی شدند. پس از توالی&#8204;یابی تعدادی از نشانگرها و همردیف کردن آنها، 68 نشانگر با ژن&#8204;های مقاومت شناخته&#8204;شده یا پروتئین&#8204;های مقاومت به بیماری گروه TIR-NBS-LRR همولوژی نشان دادند. هفت تا از این RGAها جایگاه ژنی و توالی مشابه با ژن&#8204;های مقاومت شناسایی&#8204;شده در سیب&#8204;زمینی یا گوجه-فرنگی داشتند. سی&#8204;و&#8204;هفت RGA توالی&#8204;یابی&#8204;شده در نواحی کروموزومی مشابه با ژن&#8204;های مقاومت شناسایی&#8204;شده یا RGAها در گوجه-فرنگی یا سیب&#8204;زمینی مکان&#8204;یابی شدند بدون اینکه با این ژن&#8204;های مقاومت یا RGAها از نظر توالی دارای همولوژی باشند و بقیه RGAها نیز در جایگاه&#8204;هایی مکان&#8204;یابی شدند که تاکنون در آنها RGA گزارش نشده &#8204;است. اکثر این RGA ها در خوشه&#8204;ها یا زیرخوشه-های جدید یا موجود در نقشه قرار گرفتند. در بررسی رابطه فیلوژنی، توالی&#8204;های RGA براساس آغازگر دژنره مورداستفاده برای تکثیر تفکیک شدند. نتایج حاصل از این پژوهش می&#8204;تواند در مکان&#8204;یابی ژن&#8204;های مقاومت منفرد و مکان&#8204;های کمی مقاومت به بیماری&#8204;ها مورداستفاده قرار گیرد.</abstract_fa>
	<abstract>To identify and isolate resistance gene analogues (RGAs) in potato, 46 genotypes from F1 diploid mapping population of SH &amp;times; RH with highest recombination were assessed by NBS profiling technique in the genomics laboratory of Wageningern University, The Netherlands. Using five degenerate primers, that were designed based on conserved motifs NBS domain, in total, 187 polymorphic markers were produced and mapped in relation to AFLP map of the population comprising 10,000 markers. Following sequencing and alignment of several markers, 68 of them revealed homology between known resistance genes or TIR-NBS-LRR type disease resistance proteins. Seven of these RGAs showed similar genetic position and sequence with resistance genes identified in potato or tomato. Thirty seven of the sequenced RGAs were mapped in the chromosomal regions similar to resistance genes or RGAs identified in tomato or potato without having sequence homology with these resistance genes or RGAs, and the rest of RGAs were mapped in positions where no RGA was reported, before. The majority of the RGAs were positioned in new or existing clusters or sub-clusters in the map. Phylogenetic analysis revealed the grouping of RGA sequences based on degenerate primers that were used for amplification. The result of this research could be used in mapping of single resistance genes and quantitative resistance loci.</abstract>
	<keyword_fa>آنالوگ‌های جمعیت نقشه‌یابی, ژن‌های مقاومت به بیماری (RGAs), سیب‌زمینی و  .NBS Profiling</keyword_fa>
	<keyword>NBS profiling, Mapping population, Potato and Resistance Gene Analogues (RGAs).</keyword>
	<start_page>185</start_page>
	<end_page>198</end_page>
	<web_url>http://agrobreedjournal.ir/browse.php?a_code=A-10-1-163&amp;slc_lang=fa&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>Sara</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Dejestan</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>سارا</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>دژستان</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>100319475328460011903</code>
	<orcid>100319475328460011903</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation></affiliation>
	<affiliation_fa>، دانشکده کشاورزی دانشگاه تبریز</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Mohammad</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Moghadam</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>محمد</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>مقدم</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>moghaddamv@yahoo.com</email>
	<code>100319475328460011904</code>
	<orcid>100319475328460011904</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation></affiliation>
	<affiliation_fa>دانشکده کشاورزی دانشگاه تبریز</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Seyyed Abolghasem</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Mohammadi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>سید ابوالقاسم</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>محمدی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>100319475328460011905</code>
	<orcid>100319475328460011905</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation></affiliation>
	<affiliation_fa>دانشکده کشاورزی دانشگاه تبریز</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Saeid</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Aharizad</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>سعید</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>اهری راد</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>100319475328460011906</code>
	<orcid>100319475328460011906</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation></affiliation>
	<affiliation_fa>، دانشکده کشاورزی دانشگاه تبریز</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Jack </first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Osen</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>ژاک</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>وسن</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>100319475328460011907</code>
	<orcid>100319475328460011907</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation></affiliation>
	<affiliation_fa>مؤسسه بین المللی تحقیقات گیاهی، واگنینگن، هلند</affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
